硝基咪唑类药物主要品种有甲硝唑、替硝唑、奥硝唑，在临床主要用于各种厌氧菌感染治疗；某些手术的预防用药如结直肠手术、妇科手术及口腔手术等；男女泌尿生殖道毛滴虫病；治疗阿米巴痢疾和肠外阿米巴病；还可以用于幽门螺杆菌治疗。甲硝唑是第一代，替硝唑是第二代，奥硝唑为第三代。
其抗菌谱及药代动力学有所差别，见表。
同时药物不良反应方面，硝基咪唑类最常见的为消化道症状（如恶心、呕吐、食欲缺乏、口中金属味、腹部绞痛、腹泻、便秘等）及神经系统症状（如头痛、眩晕、共济失调、疲倦、癫痫、抽搐、多发性神经炎等），但不良反应症状往往较轻，停药后即可恢复，还有一些其他不常见不良反应的如白细胞减少、肝功能异常、皮疹、皮肤瘙痒、腰部胀痛、周围神经的病变（肢端麻木、感觉异常）等。
临床中甲硝唑的不良反应最多，替硝唑、奥硝唑耐受性较好，不良反应相对少见。
生活中需要注意的是，硝基咪唑类（主要为甲硝唑、替硝唑）有“双硫仑样反应”，甲硝唑与替硝唑可抑制乙醛脱氢酶，因而导致乙醇蓄积，产生醉酒反应，在用药期间和停药后1周内，应戒酒及禁用含乙醇饮料。奥硝唑目前认为无“双硫仑样反应”，但仍建议不要饮酒。
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